En 1940 cambió su nombre Baleares Foot-Ball Club por Club de Fútbol Baleares, equipacion atletico de madrid obligado por las directrices del régimen franquista que obligaban a castellanizar toda la terminología deportiva. El club estuvo a punto de participar en la Olimpiada Popular de Barcelona que iba a celebrarse del 19 al 26 de julio de 1936; el alzamiento militar hizo que sus jugadores se encontrasen casualmente en la zona republicana al iniciarse la Guerra Civil Española.
